Le lac Michigan abrite du saumon coho, de la perchaude, de la truite arc-en-ciel, de la truite brune, de l'achigan à petite bouche, de plusieurs espèces de crapets, des espèces de truite arc-en-ciel, du saumon quinnat et du touladi. Le lac Michigan est ensemencé chaque année avec plus plus de 15 millions de poissons. Les poissons les plus couramment ensemencés sont la truite brune, le saumon coho et le saumon quinnat.
Le meilleur moment pour pêcher le saumon coho dans le lac Michigan se situe entre la mi-février et le mois de mai et pendant les mois de septembre et d'octobre. Le saumon coho du lac Michigan pèse entre 2 et 3 livres.
Le meilleur moment pour pêcher le saumon quinnat est en mai et entre la mi-juillet et septembre. Le saumon quinnat peut être pêché dans le lac Michigan à partir de bateaux, de certains quais et dans les ruisseaux. La taille moyenne varie entre 7 et 12 livres.
La population de truites arc-en-ciel dans le lac Michigan culmine de la mi-juin à août lorsqu'elle pêche à partir d'une jetée ou d'un bateau et de juillet à février lorsqu'elle pêche à partir d'un ruisseau. La truite arc-en-ciel moyenne dans le lac Michigan pèse entre 7 et 10 livres.
Le touladi, qui pèse de 8 à 12 livres, est mieux pêché en bateau de la mi-juin à août et de la mi-octobre à début novembre.