Les deux pays avec des drapeaux carrés sont la Suisse et le Vatican. Cependant, le drapeau suisse peut être vu aux Jeux Olympiques avec une proportion rectangulaire de 2:3 qui correspond aux drapeaux des autres pays.
Le drapeau suisse est carré et de couleur rouge avec une croix blanche. En mer, cependant, le Swiss Naval Ensign est utilisé; il a des proportions rectangulaires 2:3 au lieu des proportions carrées 1:1. Le drapeau est conservé dans des proportions carrées standard lorsqu'il flotte à l'extérieur du siège des Nations Unies à New York et à Genève.
Le drapeau du Vatican est divisé verticalement avec du jaune sur le côté gauche et du blanc sur le côté droit. Dans le côté droit blanc, il y a un emblème qui a deux clés croisées avec un diadème papal. L'emblème est une référence aux clés qui sont mentionnées dans le Nouveau Testament de la Bible et symbolise soit : l'accès de Saint-Pierre au royaume des cieux ou la domination de la papauté sur les questions temporelles et spirituelles. Le drapeau du Vatican était autrefois rouge et or, mais a été remplacé par des rayures jaunes et blanches au début du XIXe siècle. Il y avait aussi des représentations de Saint Pierre et Saint Paul.