L'hétérosis, la redondance génétique et l'autofécondation sont trois avantages d'une plante qui devient polyploïde. Les plantes polyploïdes montrent une plus grande adaptabilité à long terme à l'évolution que leurs diploïdes correspondants et sont protégées des effets néfastes des mutations.
L'hétérosis est défini comme une espèce végétale croisée ayant des qualités supérieures à celles de l'un ou l'autre de ses parents. Les plantes polyploïdes en profitent de plusieurs manières. Par exemple, les allopolyploïdes, qui sont des polyploïdes avec des chromosomes dérivés d'espèces différentes, empêchent la recombinaison intergénomique, ce qui permet aux générations suivantes d'avoir la même quantité d'ensembles variés de chromosomes ou différents allèles correspondant à la même position sur les chromosomes. Essentiellement, cela signifie une plus grande variété génétique.
La redondance génétique se produit lorsque plusieurs gènes d'une espèce végétale remplissent la même fonction, donc si un gène mute d'une manière qui n'est pas bénéfique pour la plante, il y en a d'autres pour assumer les fonctions nécessaires à la survie de l'organisme. Les plantes polyploïdes tirent parti de la redondance génétique en masquant les gènes récessifs. Les cheveux roux sont un exemple de gène récessif chez l'homme. Une personne aux cheveux roux doit avoir deux gènes de cheveux roux. Tout autre gène de couleur de cheveux est dominant sur le rouge et masque son expression. Chez les plantes, les traits récessifs ont tendance à être dommageables, donc l'expression de gènes dominants est avantageuse pour sa survie. La redondance des gènes permet également aux plantes de diversifier la fonction des gènes.