Le mucus est produit par les membranes spécialisées qui tapissent les organes des cavités corporelles qui s'ouvrent vers l'extérieur, telles que celles trouvées dans les systèmes respiratoire, digestif et reproducteur. Bien que le mucus soit une sécrétion qui est le plus souvent connu pour sa présence dans les cavités nasale et buccale, il est également produit dans l'estomac, l'œsophage et dans les vésicules séminales mâles. La sécrétion de mucus joue un rôle vital en tant que milieu protecteur et de transport dans les fonctions internes des systèmes digestif, respiratoire et reproducteur de l'homme et d'autres vertébrés.
Le mucus produit dans le système respiratoire humain protège les poumons en limitant les particules étrangères qui les atteignent. Le mucus dans les voies nasales et les voies respiratoires piège les petites particules, telles que la poussière, les allergènes et les bactéries, avant qu'elles ne pénètrent dans le système. Le flegme fait référence à un type spécifique de mucus qui est normalement confiné aux voies respiratoires. Le mucus nasal est produit par les tissus qui tapissent les organes des voies respiratoires, tels que ceux qui tapissent la trachée et les bronchioles. Une production continue de mucus nasal hydrate l'air inhalé et empêche également les voies respiratoires et les tissus nasaux de s'assécher.
Dans le système digestif humain, le mucus empêche les parois cellulaires de l'estomac d'être endommagées par la forte concentration d'acide présente dans l'organe. L'œsophage utilise du mucus comme lubrifiant pour faciliter le passage des aliments vers l'estomac.