Les principales différences entre les chloroplastes et les mitochondries sont que les chloroplastes contiennent des molécules de pigment et des molécules de thylacoïde, tandis que les mitochondries ont des enzymes respiratoires qui manquent aux chloroplastes. Les mitochondries apparaissent dans le cytoplasme des cellules qui contiennent un noyau, convertissant les nutriments en molécules de carburant pour les cellules. Les chloroplastes, quant à eux, sont les portions d'algues et de cellules végétales dans lesquelles se produit la photosynthèse.
Dans le cadre de la photosynthèse, les chloroplastes possèdent la capacité de transformer le carbone provenant du dioxyde de carbone en sucre à l'aide de la lumière. Les mitochondries prennent les sucres et les décomposent en énergie et en dioxyde de carbone. Les chloroplastes ont une grande taille et plus de complexité que les mitochondries, et en plus de convertir le carbone en sucre, ils synthétisent également des acides gras, des acides aminés et des lipides.
Les mitochondries apparaissent dans les cellules animales et végétales, mais les chloroplastes n'apparaissent que dans les cellules végétales. En fait, ce sont les chloroplastes qui donnent à la majorité des plantes leur couleur verte. Les mitochondries ont en fait la structure d'une cellule procaryote, mais les chloroplastes sont constitués de plusieurs thylakoïdes empilés et entourés d'un fluide appelé stroma. Les mitochondries sont connues sous le nom de « centrale électrique » pour les cellules animales, car elles créent de l'énergie. Ces deux organites symbolisent la division entre le règne végétal et le règne animal.
