Les cartes mères ATX et BTX sont construites légèrement différemment, avec des emplacements positionnés dans des zones différentes et la distance entre la carte mère et le châssis du PC augmentée dans le BTX. En termes de disposition, la carte mère BTX reflète la carte mère ATX. Le BTX offre un espace d'installation à gauche avec des espaces vides pour les câbles à droite, et l'ATX est disposé vice versa.
En 2004, Intel a annoncé le développement de la carte mère BTX, destinée à remplacer le standard ATX de l'époque. Le BTX a promis une ventilation interne améliorée pour contrer des vitesses d'horloge plus élevées et plus de composants générant plus de chaleur. L'introduction de la carte mère BTX était une tentative de standardiser les formats des petites cartes mères.
En raison de la disposition et des différences structurelles entre les cartes mères BTX et ATX, elles ne peuvent pas être installées dans des boîtiers interchangeables. De plus, la carte mère BTX utilise des emplacements PCI Express avec une prise à 24 broches, tandis que l'ATX utilise une prise à 20 broches.
L'ATX a été lancé en 1995, mais il a fallu deux ans pour devenir la norme. Le BTX n'a pas réussi à obtenir un succès similaire dans le commerce de détail, en partie à cause d'un manque d'intérêt des utilisateurs pour le système de refroidissement amélioré. Cependant, Dell et Gateway ont tous deux lancé des produits BTX.
