Les poissons-clowns ont développé de nombreuses adaptations différentes, la plus célèbre étant leur résistance aux piqûres d'anémones de mer, ce qui leur permet de vivre en toute sécurité dans les tentacules de l'anémone sans se faire piquer. D'autres adaptations de poissons-clowns incluent leur capacité à détecter la bonne espèce d'hôte anémone à l'aide de stimuli olfactifs; leurs nageoires caudales arrondies qui leur permettent de s'éloigner rapidement des prédateurs ; et leurs couleurs vives, qui servent d'avertissement.
Les couleurs orange vif et blanc d'un poisson-clown avertissent les autres poissons de rester à l'écart, mais le poisson-clown peut également blanchir sa peau la nuit, ce qui camoufle sa couleur et lui permet de mieux se cacher dans les tentacules de l'anémone.
Les poissons-clowns peuvent vivre en toute sécurité dans les tentacules d'une anémone en raison du mucus spécial qu'ils ont sur leur peau, qui les protège des piqûres de l'anémone ; Cependant, les poissons-clowns doivent d'abord toucher progressivement les tentacules de diverses parties de leur corps pour développer une résistance à cette espèce particulière d'anémone. On pense que les poissons-clowns ne sont immunisés que contre une seule espèce d'anémone à la fois et qu'ils doivent reconstruire leur résistance s'ils n'entrent pas en contact avec cette espèce pendant un certain temps.
Une autre adaptation est que tous les poissons-clowns naissent mâles, seul le poisson le plus dominant d'un groupe devenant la femelle. Si la femelle meurt, le mâle dominant du groupe devient alors la femelle, ce qui contribue à assurer la survie de l'espèce.