Bien qu'il ne puisse y avoir de "meilleure" équipe définitive dans Pokémon, il existe des listes de niveaux qui classent les meilleurs Pokémon de chaque génération en fonction de leurs statistiques, de leur efficacité au combat et de leur classement par rapport aux autres Pokémon. En raison de nouveaux mouvements, de nouveaux Pokémon et de nouveaux types de matchs à chaque génération, ces niveaux changent à chaque partie. Pour Pokémon Emerald, les meilleurs Pokémon sont ceux du niveau uber de troisième génération.
Il existe neuf niveaux officiels dans Pokémon : pas complètement évolué, petite coupe, jamais utilisé, limite 3, rarement utilisé, limite 2, sous-utilisé, limite, surutilisé et uber. Le niveau uber contient le Pokémon le plus puissant. Le niveau uber de troisième génération est entièrement composé de Pokémon légendaires, à l'exception de Wobbuffet et Wynaut. Ceux-ci incluent Mewtwo, Mew, Lugia, Ho-oh, Latias, Latios, Kyogre, Groudon, Rayquaza et toutes les formes de Deoxys. Cependant, il convient de noter que cela n'inclut que six des 17 types disponibles dans les Pokémon de troisième génération. Par conséquent, une équipe comprenant uniquement ces Pokémon peut ne pas bien rivaliser avec d'autres équipes uniquement en raison de désavantages de type. Cela peut valoir la peine d'utiliser des Pokémon du niveau surutilisé le plus diversifié. Ceux-ci incluent des Pokémon tels que Gengar, Rhydon, Umbreon et Raiku. Il est également important de prendre en compte la formation et les capacités des véhicules électriques. Avec un entraînement approprié, même un Pokémon de l'un des niveaux inférieurs peut résister à un uber ou surexploiter.