Les cœurs reptiliens, en grande partie similaires aux cœurs d'amphibiens, sont à trois chambres et assurent une séparation modérée du sang oxygéné et désoxygéné avec leurs deux oreillettes, l'une qui reçoit le sang oxygéné et l'autre qui reçoit le sang désoxygéné des poumons. Le ventricule du cœur reptilien permet encore au sang oxygéné et désoxygéné de se mélanger, ce qui signifie qu'il n'est pas aussi robuste ou aussi efficace qu'un cœur de mammifère.
La séparation du sang se produit parce que l'arrivée du sang est chronométrée indépendamment à travers les oreillettes. Si le sang arrive par les deux oreillettes simultanément, alors le mélange se produit, mais cela peut être à un degré plus ou moins élevé en fonction de la température corporelle et de l'état d'activité de l'animal.
Une fois que le sang atteint le cône artériel, il est aspiré par les trois canaux du tronc artériel, l'entrée du système circulatoire, puis se déplace dans le reste du corps reptilien. Le cône mène à trois systèmes distincts, le système du tronc pulmonaire et les systèmes du tronc systémique gauche et droit.
Les cœurs des mammifères sont orientés vers une activité constante et des niveaux élevés de mouvement et d'effort, tandis que les cœurs reptiliens fonctionnent mieux dans de courtes périodes et nécessitent que l'animal se repose fréquemment et travaille pour contrôler sa température corporelle. Des niveaux inférieurs d'oxygène dans le sang rendent les reptiles paresseux et enclins à dormir.
