Pour la décomposition la plus rapide et la plus complète du papier toilette dans la fosse septique, le papier toilette monocouche est le meilleur. Le papier toilette ordinaire est également acceptable; il n'y a aucune preuve que tout type de papier toilette endommage les fosses septiques ou les champs d'épuration.
Le papier toilette annoncé comme étant plus épais et plus doux prend plus de temps à se décomposer dans la fosse septique, ce qui peut signifier un pompage plus fréquent de la fosse. InspectAPedia recommande aux personnes ayant une fosse septique d'utiliser du papier hygiénique recyclé, car c'est une option plus écologique. Les arbres n'ont pas besoin d'être coupés pour fabriquer du papier toilette recyclé, et moins d'eau de Javel à base de chlore est utilisée dans sa production, ce qui diminue la pollution des eaux souterraines.