Le climat de la zone intertidale dépend du climat de la région environnante. Par exemple, le climat de la zone intertidale le long de la côte de l'Antarctique est glacial et instable, tandis que le climat de la la zone intertidale d'une île tropicale est chaude et stable.
Parce que l'eau de la zone intertidale est si peu profonde, elle est sujette à changement en fonction des conditions météorologiques de l'air au-dessus. Dans les régions où les conditions météorologiques changent fréquemment, les zones intertidales peuvent manquer de biodiversité, car de nombreux organismes aquatiques ne sont pas capables de s'adapter au climat instable. Un autre obstacle à la biodiversité est la forte teneur en sel de nombreuses zones intertidales.
