Thomas Jefferson n'a pas approuvé l'accise sur le whisky et le tarif protecteur que le président Hamilton a pu approuver au Congrès. Dès que Jefferson a été élu, il a cherché des moyens de traiter avec les États-Unis ', et a aboli toutes les taxes intérieures aux États-Unis, y compris l'accise sur le whisky et le tarif protecteur.
Le président Hamilton voulait la taxe d'accise sur le whisky, car il estimait que la taxe était nécessaire pour fournir aux États-Unis un financement supplémentaire. Ce financement était primordial pour son nouveau plan de prise en charge. Il a également estimé que l'industrie du whisky avait suffisamment d'importance et de revenus pour être en mesure de gérer la taxe.
Jefferson a accepté la taxe d'accise de Hamilton parce qu'il avait déjà accepté le plan de prise en charge. Madison a également été contraint d'accepter la taxe d'accise sans poser de questions car lui aussi avait déjà donné son approbation au plan de prise en charge et c'était la façon dont Hamilton allait payer pour son plan. Lorsque Jefferson a pris ses fonctions, il voulait mettre fin au plan de Hamilton et ne croyait pas qu'il réussissait. Il est allé au Congrès avec quatre objectifs, dont la réduction des impôts du peuple, la réduction de la dette nationale, l'équilibre budgétaire et la limitation des dépenses gouvernementales.
