Les huîtres se nourrissent de plancton, d'algues et de petites particules de nourriture qui se déposent sur leurs branchies. Les huîtres et les palourdes utilisent le même type de système de siphonnage et de filtration pour retirer la nourriture de l'eau qui les entoure.
Lorsque l'eau se lave sur une huître, elle pousse l'eau à travers son corps et extrait tout plancton ou petites particules de végétation aquatique. Les huîtres sont appelées filtreurs car elles filtrent essentiellement leur nourriture hors de l'eau.
La nourriture qu'une huître mange peut affecter ce qu'une personne trouve lors de l'ouverture de l'huître. Selon la couleur des algues consommées, une huître peut avoir une coloration verte ou rouge à l'intérieur.