Les mouches des fruits préfèrent les aires d'accouplement, de reproduction et d'alimentation sucrées et biologiques, et sont capables de détecter et de suivre l'odeur des fruits et légumes mûrs de loin. Bien qu'ils préfèrent le sucre, ils infestent également la viande pourrie et les ordures, et sont attirés par les sodas et l'alcool.
Une fois qu'une colonie de mouches des fruits est établie, même enlever les fruits peut ne pas suffire à les empêcher de se reproduire. Les mouches des fruits peuvent se reproduire dans la boue ou sur de vieilles vadrouilles et éponges acides. Ils peuvent passer de l'œuf à l'adulte en huit jours et vivre 30 jours complets, se reproduisant rapidement.
Au fil du temps, leur population peut être écrasée en supprimant leur accès à la nourriture. Les fruits et légumes trop mûrs doivent être immédiatement jetés. Les mouches des fruits sont très petites et peuvent se frayer un chemin à travers de minuscules fissures. Conservez donc tous les aliments dans des contenants hermétiques ou au réfrigérateur.
Essuyez et vaporisez régulièrement les comptoirs, en nettoyant immédiatement les déversements. Videz les poubelles sans laisser le temps aux aliments de pourrir et d'attirer les mouches des fruits. Nettoyez les drains en y versant de l'eau bouillante ou de l'eau de Javel, et des digesteurs bactériens peuvent être nécessaires pour éradiquer complètement la boue que les mouches des fruits peuvent utiliser pour se reproduire. Les pièges peuvent se débarrasser des adultes, contribuant ainsi à réduire la population au fil du temps.