Parce qu'ils n'ont pas d'ouvertures séparées pour la reproduction et l'excrétion, l'ouverture intestinale postérieure dans les systèmes excréteurs des requins est appelée cloaque plutôt qu'anus. Dans le système digestif des requins, la nourriture passe par un seul intestin court et est ensuite expulsée par le cloaque.
Chez les requins, la nourriture passe d'abord par l'œsophage, où des extensions en forme de doigt empêchent la nourriture de s'échapper. Les estomacs des requins sont en forme de J et mesurent environ 20 pour cent de leur longueur. Les parois musculaires de l'estomac ont des cellules qui produisent de l'acide chlorhydrique qui ramollit et dissout les os, et du mucus pour protéger la muqueuse de l'estomac. Des anneaux de muscle sur les parois de l'estomac effectuent le péristaltisme pour mélanger et décomposer la nourriture. L'intestin est le site d'absorption des nutriments. Chez l'homme, les intestins courts et longs combinés mesurent environ 28 pieds de long, alors que l'intestin d'un requin ne mesure qu'un pied de long, mais beaucoup plus large. L'intestin d'un requin travaille très lentement pour digérer la nourriture. Les humains peuvent annuler leur nourriture seulement 4 heures après avoir mangé, mais chez les requins, le processus peut prendre de 16 à 17 heures.
Une autre méthode utilisée par un requin pour évacuer les déchets consiste à retourner son estomac. Lorsqu'il a de la matière non digestible dans son estomac, il expulse son estomac à l'envers par la bouche, rince l'estomac à l'eau de mer et le rétracte dans sa position normale.
