Le poisson rouge semble seulement souffler des bulles lorsqu'il ouvre sa bouche pour aspirer de l'eau afin d'absorber l'oxygène. Parfois, lorsque le poisson ouvre la bouche, l'air s'échappe et crée une poche qui se transforme en une bulle et donne l'impression que le poisson fait des bulles.
Le poisson rouge, comme tous les autres poissons, respire de l'oxygène. Cependant, contrairement aux mammifères qui utilisent les poumons pour respirer de l'air afin d'absorber l'oxygène, les poissons rouges utilisent un organe appelé branchies. Selon le Northeast Fisheries Science Center, les poissons ne respirent pas dans l'eau, mais aspirent l'eau par la bouche pour lui permettre de passer par les branchies. Lorsque l'eau passe sur les fines membranes branchiales, les branchies absorbent l'oxygène de l'eau. L'oxygène se dissout dans les vaisseaux sanguins des branchies et passe dans la circulation sanguine du poisson rouge. Une fois le sang oxygéné, le sang est pompé à travers le corps du poisson.
Un échange gazeux se produit également au niveau des branchies. Comme les branchies absorbent l'oxygène, il libère également du dioxyde de carbone dans l'eau. Ensuite, l'eau, qui est maintenant remplie de dioxyde de carbone, est libérée et évacuée des branchies à travers l'opercule. Les autres invertébrés aquatiques qui ont des branchies comprennent les crabes et les mollusques.