La diversité génétique est si importante car elle aide les organismes à faire face à la variabilité environnementale actuelle, ainsi qu'à réduire les effets potentiellement délétères de la reproduction par des proches parents. La diversité génétique est également la base principale de l'adaptation au visage de l'incertitude environnementale future.
Les organismes existent dans des environnements variés. Ces environnements changent en fonction de conditions telles que la disponibilité des ressources, les conditions météorologiques, les événements perturbateurs et la taille des populations des sociétés d'organismes concurrents. Si les organismes vivaient dans un environnement stable sans grande variation, alors un phénotype standard pourrait être idéal car le phénotype serait adapté de manière optimale aux conditions de l'environnement stable. Cependant, parce que le monde est naturellement plein d'environnements instables, de multiples phénotypes sont nécessaires, en particulier pour prévenir les maladies par la résistance aux maladies génétiques. Les populations génétiquement identiques sont particulièrement vulnérables aux agents pathogènes et aux maladies.
Les parents proches qui se reproduisent et ont une progéniture créent une progéniture qui manque de variation génétique. Cette absence de variation génétique conduit souvent à l'expression de gènes et de traits moins bénéfiques à la reproduction ou à la survie dans le monde. Il peut également créer des problèmes physiologiques ou comportementaux qui découlent du manque de variation génétique, notamment un mauvais équilibre biochimique, une structure physique mal formée, une formation et un fonctionnement inappropriés des organes et une susceptibilité aux maladies. La consanguinité est donc un problème sérieux pour les organismes et les populations d'organismes.
