La coupe d'arbres affecte gravement les habitats de la flore et de la faune forestières, ce qui peut éventuellement conduire à l'extinction d'espèces vulnérables. En plus de provoquer l'érosion des sols, la déforestation entraîne également une plus grande quantité de gaz à effet de serre atteignant l'atmosphère, car les arbres ne peuvent pas absorber le dioxyde de carbone une fois abattus.
Environ 70 % de la flore et de la faune mondiales vivent dans les forêts. À mesure que les arbres sont abattus, les populations végétales et animales diminuent, ce qui met en danger les moyens de subsistance de la population humaine qui dépend des forêts pour se nourrir, se soigner et d'autres produits. Dans certaines parties de l'Asie du Sud-Est, la déforestation a entraîné des migrations et des conflits sociaux.
Les arbres atténuent normalement les effets de la pollution atmosphérique causée par l'émission de dioxyde de carbone et d'autres gaz à effet de serre. À mesure que les arbres sont abattus, la combustion des combustibles fossiles nécessaires au fonctionnement des machines de coupe du bois et des gros véhicules de transport aggrave encore la pollution.
Le sol perd de sa cohésion et devient susceptible de se dessécher s'il n'y a pas de racines d'arbre pour l'ancrer. Une fois que cela se produit, le sol ne peut plus produire de nourriture. À cause de l'érosion des sols, les sources d'eau, comme les lacs et les rivières, sont polluées par le limon, ce qui diminue la qualité de l'eau et entraîne des problèmes de santé et un manque d'eau potable. L'abattage d'arbres perturbe également le cycle de l'eau, car les racines des arbres fondent normalement l'eau et la libèrent dans l'atmosphère. L'équilibre du cycle de l'eau, du débit des rivières et des précipitations se dégrade sans arbres.