Les méthanogènes vivent dans des environnements anaérobies, tels que les marécages, les marais, le rumen des bovins, l'intestin des termites et les boues d'épuration. Ces bactéries sont des chimioautotrophes, qui utilisent l'hydrogène comme source d'électrons pour réduire le dioxyde de carbone. Ils émettent du méthane en tant que déchet de ce processus.
Les méthanogènes sont des micro-organismes unicellulaires anaérobies. Ils sont lithotrophes et produisent leur propre énergie par le processus de méthanogenèse. Dans leurs habitats, les méthanogènes dégradent les molécules et composés organiques complexes pour aider à recycler les éléments et les nutriments dans l'écosystème. Au total, ils produisent environ 109 tonnes de méthane par an, dont environ la moitié s'échappe dans l'atmosphère.