Les pandas géants ont des queues, mais chez les adultes, elles passent souvent inaperçues car les queues représentent moins de 10 % du corps total d'un adulte. La queue d'un panda géant adulte est également souvent repliée près du corps, ce qui le rend difficile à repérer.
La glande circumanale à la racine de la queue d'un panda géant excrète une substance à l'odeur acide. Un panda géant utilise sa queue pour enduire cette substance et son odeur sur les souches d'arbres, les murs et autres surfaces pour marquer son territoire. Une femelle panda géant peut également utiliser sa queue pour marquer une zone avec une odeur pour indiquer qu'elle est prête à s'accoupler.