Les cobayes ne sont pas des animaux nocturnes. Leurs horaires consistent en une alternance de périodes d'activité et de sommeil qui se produisent pendant la journée et la nuit, bien que leur niveau d'activité soit légèrement plus élevé à l'aube et au crépuscule.
Pendant les périodes d'activité, les cobayes mangent un régime composé d'herbe, de foin et de granulés de leurs propres excréments pour réabsorber les nutriments nécessaires. Ce sont des créatures sociales et se lient étroitement les uns aux autres. Les cochons d'Inde sont également facilement excitables et enclins à sauter à plusieurs reprises dans les airs. Ce comportement est appelé popcorning. Les cobayes domestiques sont une espèce distincte de celles qui existent dans la nature. La durée de vie d'un cobaye domestique est en moyenne de quatre à six ans.