En 2000, Anna Stanley a divorcé de son mari, Charles Stanley, qui était le pasteur principal de la First Baptist Church dans le nord d'Atlanta, en Géorgie, et fondateur de In Touch Ministries. Ils ont été mariés pendant 44 ans. .
Dans sa demande de divorce, Anna a qualifié leur mariage de "irrémédiablement brisé". La nouvelle de leur mariage en difficulté est devenue publique pour la première fois dans les années 1990 et était controversée parce que la First Baptist Church avait une règle non écrite qui interdisait aux hommes divorcés de devenir ministres ou diacres. Lorsque le couple s'est séparé, Charles a juré de démissionner de son poste de pasteur s'il devait divorcer. Cependant, après que le divorce soit devenu définitif, la First Baptist Church a permis à Charles Stanley de continuer à être son pasteur principal.
Le couple partage deux enfants. Leur fils, Andy Stanley, est pasteur principal de l'église communautaire de North Point et fondateur de North Point Ministries.
