La réponse lumineuse chez les plantes est une série complexe de déclencheurs et de boucles de rétroaction utilisant certaines protéines de la cellule pour préparer et traiter la lumière, ce qui entraîne une croissance, une floraison et une tension vers la lumière. Les protéines responsables de la réponse lumineuse sont FHY3, FAR1, FHY1, FHL et le phytochrome A.
Les plantes commencent à réagir à l'absence de lumière en produisant la paire de protéines appelées FHY3 et FAR1. Ces deux protéines augmentent la production d'une autre paire de protéines appelées FHY1 et FHL. La plante stocke ces protéines afin de pouvoir réagir à la lumière dès qu'elle est disponible. Une protéine connue sous le nom de phytochrome A détecte la lumière à l'extrémité rouge du spectre, commençant la réponse lumineuse de la plante avant que les humains ne puissent la voir.
Lorsque le phytochrome A est activé, il se lie avec FHY1 et FHL, ce qui entraîne l'accumulation de phytochrome A dans le noyau de la cellule. Le phytochrome A ajuste l'activité des gènes du noyau cellulaire responsables du développement de la plante. Lorsque l'activité des gènes change, la plante répond par une croissance, une floraison ou une tension vers la lumière. Comme plus de phytochrome A s'accumule dans le noyau, moins de FHY3 et FAR1 sont produits, créant une boucle de rétroaction négative qui limite la réponse lumineuse de la plante.