Les chauves-souris femelles prennent soin de leurs petits à la naissance en les tenant dans une poche à membrane et en les allaitant. Pendant un certain temps après la naissance, elles peuvent porter leurs petits bébés avec elles pendant qu'elles tètent, mais les mères les laissent plus tard au perchoir, revenant fréquemment les nourrir.
Les chauves-souris femelles n'ont généralement qu'un seul bébé à la fois, peut-être à cause de la nécessité de voler et de se nourrir même pendant la grossesse. Au moment de mettre bas, les femelles de certaines espèces pendent la tête haute par leurs pouces et attrapent leurs bébés dans une membrane caudale, tandis que d'autres espèces pendent la tête en bas et attrapent le bébé avec leurs ailes. Les chiots chauves-souris naissent les yeux fermés et glabres et s'accrochent immédiatement à leur mère avec leurs griffes acérées et parfois avec leurs dents.
Selon la taille de l'espèce de chauve-souris, les bébés chauves-souris peuvent s'accrocher à leur mère pendant qu'ils volent et se nourrissent pendant quelques jours à quelques semaines. Lorsqu'ils sont trop lourds à porter, les mères les laissent s'accrocher à un mur, une branche, le toit d'une grotte ou un autre abri pendant qu'ils cherchent de la nourriture. Le taux de mortalité des bébés chauves-souris est élevé, car certains bébés chauves-souris tombent de leur perchoir et sont incapables de remonter.
Selon l'espèce de chauve-souris, les jeunes chauves-souris développent pleinement leurs ailes et acquièrent la capacité de voler en trois semaines à quatre mois. Quand ils le font, ils sont responsables de chasser leur propre nourriture.
