En tant qu'iodophore, associé à une solution ou à un support solubilisant, l'iode est censé présenter des propriétés désinfectantes car il pénètre les parois cellulaires d'un organisme et perturbe la structure et la synthèse des protéines et des acides nucléiques. Ces solutions sont utiles à la fois comme désinfectants et antiseptiques.
Les solutions d'iode sont utilisées dans une variété d'environnements où une action antiseptique ou désinfectante est requise. Dans les établissements de santé, ils sont utilisés pour désinfecter le matériel, comme les flacons d'hémoculture, les thermomètres, les réservoirs d'hydrothérapie et les endoscopes.
Les solutions d'iodophore ne sont pas recommandées comme désinfectants pour surfaces dures en raison des différences de concentration. Ils ne sont pas non plus recommandés pour une utilisation avec des cathéters en silicone en raison du potentiel de rupture du matériau.