Les vaches ont 60 chromosomes : une seule paire de chromosomes sexuels et 29 paires d'autosomes. Comme pour les autres mammifères, les femelles ont toutes deux des chromosomes X, et les mâles ont un seul Y et chromosome X.
Selon le Département des sciences animales et avicoles de l'Université de la Saskatchewan, au cours des étapes de la gamétogenèse, les chromosomes de la vache subissent un processus de méiose. Il en résulte une cellule reproductrice principale qui produit trois corps polaires et un ovule. La vache contribue à un seul des chromosomes X dans le processus de méiose. Tous les chromosomes sont en forme de larme et ont le centromère à la fin, à l'exception des chromosomes sexuels, qui présentent le centromère plus vers le milieu du chromosome.