Il y a entre 326 et 351 os dans le squelette de l'éléphant d'Afrique. Il a un total de 61 vertèbres, et ses os sont minces et se fracturent facilement.
L'éléphant d'Afrique a 21 côtes et ses vertèbres sont maintenues ensemble par des articulations serrées. Le crâne est suffisamment solide pour résister aux coups de tête, ainsi qu'à tout effet de levier qu'il peut obtenir en utilisant ses défenses. Le crâne contient également des cavités d'air qui allègent le crâne pour maintenir la force globale. Les os représentent environ 12 à 15 pour cent du poids corporel de l'éléphant. Les os de ses membres sont spongieux et n'ont pas de cavité médullaire. Le cou de l'éléphant d'Afrique est presque horizontal en raison de sa double épine. Cela aide à supporter le poids de ses grandes défenses.