Parmi les alliés d'Athéna se trouvaient de nombreux héros de la mythologie grecque, dont Ulysse, Jason, Persée et Héraclès. Parce qu'elle s'est rangée du côté des Grecs dans la guerre de Troie, ses ennemis comprenaient Paris et les autres défenseurs de Troie. Parmi les dieux, ses adversaires comprenaient Héphaïstos et Poséidon.
Selon la mythologie grecque, Athéna a aidé Jason à acquérir la toison d'or. Elle a également aidé Persée à décapiter Méduse. Elle a conseillé à Héraclès d'utiliser les propres griffes du lion de Némée pour couper sa peau imprenable, lui a donné un hochet pour effrayer les oiseaux de Stymphale afin qu'il puisse les tuer et l'a aidé à entrer dans le monde souterrain pour vaincre Cerbère. Athéna a conseillé Ulysse tout au long de la guerre de Troie, l'a protégé dans ses errances, l'a guidé chez lui et l'a aidé à retrouver sa maison et sa femme.
Un mythe grec raconte qu'Aphrodite, Héra et Athéna prétendaient toutes être la plus belle des déesses, et Zeus désigna Paris, un prince troyen, pour les départager. Paris a choisi Aphrodite plutôt qu'Athéna, ce qui a amené Athéna à favoriser le côté grec lors de la guerre de Troie. Bien qu'Arès et Athéna fussent tous deux des représentants de la guerre, elle symbolisait la sagesse, la perspicacité, le courage, la gloire et la supériorité morale plutôt que la peur et la soif de sang. Bien qu'Athéna soit reconnue comme une déesse vierge, elle est devenue mère. Héphaïstos, le fils de Zeus et d'Héra, a essayé de la violer, et lorsque sa semence est tombée de sa jambe sur la terre, le mi-serpent, mi-homme Erichthonius est né. Poséidon est devenu l'adversaire d'Athéna en raison d'une dispute sur qui serait le patron d'Athènes. Dans leur compétition, ils ont chacun offert des cadeaux aux Athéniens. Poséidon a offert aux Athéniens une fontaine d'eau salée, mais Athéna a gagné en leur offrant un olivier.