De nombreux botanistes utilisent des outils tels que des loupes, des appareils photo, des appareils GPS, des guides de terrain et des ordinateurs. De plus, un simple cahier et un crayon sont des outils précieux qui permettent aux biologistes de terrain d'enregistrer leurs observations. Les botanistes utilisent une variété d'outils différents, selon leur spécialité et la tâche spécifique qu'ils essaient d'accomplir.
Certains botanistes travaillent dans des laboratoires avec des outils et des équipements très avancés. Par exemple, les botanistes qui tentent d'étudier l'ADN ou la structure microscopique d'une plante peuvent avoir besoin de microscopes et d'autres équipements de laboratoire de haute technologie. D'autres botanistes travaillent dans des serres, étudiant les habitudes de croissance et les besoins en nutriments des plantes. Ces scientifiques doivent utiliser des hygromètres, des kits d'analyse du sol et d'autres appareils de mesure. Les botanistes à vocation académique, en particulier ceux qui se concentrent sur l'étude de la taxonomie ou de la systématique, passent la plupart de leur temps à utiliser des ordinateurs et à consulter des livres pour terminer leur travail.
Les sécateurs, cisailles et ébrancheurs sont utilisés par des botanistes aux spécialités variées, notamment parmi ceux qui travaillent dans le domaine. Certains botanistes utilisent un outil appelé hori-hori pour déterrer les racines de petites plantes herbacées. Les conteneurs et les sacs de collecte sont utiles pour le transport des échantillons au laboratoire pour une analyse plus détaillée. Les presses à plantes sont également des outils utiles qui permettent aux botanistes de conserver les feuilles pour une étude future.
