Certaines des principales formes de relief trouvées au Honduras comprennent le grand plateau intérieur de collines et de montagnes, les basses terres du Pacifique et les basses terres des Caraïbes. Le climat varie de tempéré dans les montagnes à tropique dans les basses terres. Un vaste réseau de rivières sillonne les montagnes de la Sierra Madre, les collines intérieures et de larges vallées fertiles se trouvent dans cette région.
Les basses terres des Caraïbes sont bordées de plages de sable et s'étendent sur la côte nord. Cette région contient la Mosquito Coast, une zone inhabitée de jungle, de lagunes et de mangroves. Les basses terres du Pacifique sont considérablement plus petites et entourent le golfe de Fonesca dans lequel se trouvent quelques îles volcaniques en sommeil. Cette zone de plaine devient marécageuse près de la côte. Dans l'ensemble, le Honduras est un pays riche en eau, l'hydroélectricité étant considérée comme l'une de ses ressources naturelles. Il n'y a qu'un seul lac important nommé lac Yojoa, mais il existe de nombreuses rivières importantes.
La région montagneuse de l'intérieur abrite la majeure partie de la population du Honduras et représente 80 % de sa superficie totale. De nombreuses vallées à fond plat se trouvent ici avec des villages, des villes et la capitale du pays, Tegucigalpa, situés sur les plus grandes. Les terres de cette région sont pour la plupart difficiles à traverser et peu propices à la culture en raison du terrain accidenté. La qualité du sol est également médiocre. Une dépression pratique et proéminente traverse le pays à travers la région des hautes terres et fournit une voie de transport relativement facile entre les côtes nord et sud.
