Certains prédateurs des méduses comprennent d'autres méduses, des crapets-soleils, des tortues de mer et des humains. Parfois, des oiseaux et d'autres poissons mordent autour du tissu interne non venimeux de la méduse, esquivant complètement les tentacules externes .
Les méduses ont un nombre limité de prédateurs, car leur corps est recouvert de cellules urticantes. Les méduses ont également peu d'avantages nutritionnels pour les prédateurs, car elles sont principalement constituées d'eau. Pourtant, le crapet de mer se nourrit de méduses, et les méduses sont la principale nourriture de certaines espèces de tortues marines. De plus, bien que les méduses de la même espèce ne se mangent pas les unes les autres, elles mangeront des méduses d'autres espèces.
Dans certaines parties du monde, les méduses sont considérées comme un mets délicat et sont vendues en tant que telles dans les restaurants. Cela met également les humains sur leur liste de prédateurs.