Selon le Penn State College of Agricultural Sciences, le principal inconvénient de l'adoucissement de l'eau est le risque potentiel pour la santé des personnes suivant un régime pauvre en sodium, car l'adoucissement de l'eau peut augmenter l'apport en sodium d'une personne. De plus, l'eau douce n'est pas potable. Étant donné que les métaux sont partiellement solubles dans l'eau, lorsque l'eau est adoucie, elle lessèche les métaux des conduites d'eau de manière beaucoup plus agressive.
Aquatechnology explique qu'avec de l'eau douce, il y a de fortes chances que le tirage initial d'eau froide d'un robinet contienne une teneur en plomb supérieure à la normale. Ainsi, l'eau adoucie du robinet ne doit pas être utilisée pour boire ou cuisiner. Les adoucisseurs d'eau ne sont pas efficaces pour éliminer le plomb et les autres métaux, le chlore et les sous-produits du chlore.
En outre, Aquatechnology souligne que le composant chlorure du composé de chlorure de sodium ou de potassium dans l'eau douce a de graves implications pour l'hydratation des humains et des plantes, car le potassium et le chlorure restreignent la libre circulation de l'eau dans les cellules du corps. La BBC souligne que l'eau adoucie ne doit être utilisée que pour laver les vêtements.
Les adoucisseurs d'eau sont également coûteux à faire fonctionner, car ils gaspillent jusqu'à 120 gallons pour 1 000 gallons livrés. L'entretien est un autre problème. Le Penn State College of Agricultural Sciences déclare qu'il est généralement nécessaire de payer pour chaque fonctionnalité supplémentaire pour les modèles dotés de fonctionnalités spéciales.