Le système de point de vente présente plusieurs inconvénients, notamment la difficulté accrue d'apprendre le système et le coût. Les systèmes de point de vente sont généralement plus populaires aujourd'hui qu'auparavant, mais de nombreux magasins dépendent toujours d'une caisse enregistreuse en raison de coût et efficacité.
Une caisse enregistreuse a moins de composants qu'un système de point de vente, ce qui signifie qu'elle est moins susceptible d'être utilisée pour la paie, les données des travailleurs, la tenue de dossiers et d'autres opérations commerciales normales. De ce fait, la caisse enregistreuse est beaucoup plus facile à apprendre. Il y a moins de façons de faire des erreurs, et il n'y a pas autant de programmes dont il faut s'inquiéter sur la machine.
Les propriétaires de petites entreprises peuvent commencer par une caisse enregistreuse et éviter de passer à un système de point de vente. C'est parce que le coût est un facteur majeur pour ceux qui recherchent des caisses enregistreuses par rapport aux systèmes de point de vente. Une nouvelle caisse enregistreuse est généralement moins chère qu'un nouveau système de point de vente, et lorsque cela est combiné avec les coûts de formation supplémentaires, cela peut conduire les magasins à s'en tenir à une configuration basée sur une caisse enregistreuse.
D'autres peuvent tout simplement ne pas avoir besoin de toutes les capacités du système de point de vente. Si la paie est effectuée sur papier ou que les ventes sont traitées chaque nuit par le personnel, le système de point de vente peut paraître trop cher pour les avantages supplémentaires qui ne sont pas nécessaires.