Bien que manger du thon ait des effets bénéfiques sur la santé, tels que l'ajout d'acides gras oméga-3 dans le corps, People for the Ethical Treatment of Animals (PETA) met en garde les gens de ne pas trop manger en raison d'un empoisonnement au mercure. Un adolescent a été cité comme exemple de personne ayant subi un empoisonnement au mercure. Le jeune homme avait des difficultés à se concentrer et à jouer au football car il consommait trop de thon en conserve.
Le thon est chargé de métaux lourds car il mange du poisson contaminé. À leur tour, lorsque les humains consomment de plus grandes quantités de thon, les métaux lourds leur sont transférés. Les métaux lourds attaquent le cœur, et des études ont montré que les hommes qui ont les niveaux les plus élevés de mercure dans le sang augmentent leurs risques de crises cardiaques et de maladies cardiaques, selon PETA.
Un autre effet secondaire de la consommation excessive de thon est la possibilité de manger du poisson malade. De nombreux thons ne sont plus pêchés en eaux libres mais sont plutôt élevés dans des fermes. Les fermes sont des enclos à poissons surpeuplés où le thon peut attraper des maladies et des parasites de près. Un autre type de thon qui peut provoquer des effets secondaires est le thon utilisé pour les sushis. PETA a partagé avec ses lecteurs que le poisson cru pourrait abriter des bactéries qui déclenchent une intoxication alimentaire. Les fruits de mer sont le déclencheur numéro un des cas d'intoxication alimentaire. L'intoxication alimentaire peut devenir si grave qu'elle nécessite une hospitalisation ou entraîne la mort.