Les deux règnes de bactéries sont les archébactéries et les eubactéries. Les deux règnes étaient autrefois classés en un seul règne, Monera, mais les deux types de bactéries ont montré suffisamment de variations pour justifier une reclassification en deux règnes distincts.
Bien que les archaebactéries et les eubactéries soient des procaryotes, ce qui signifie qu'elles n'ont pas de structures liées à la membrane appelées organites, les deux règnes ont tellement de différences entre eux que chacun appartient à un domaine distinct. Les quatre autres règnes, protistes, champignons, plantes et animaux, appartiennent à un même domaine.
Les archébactéries comprennent des organismes qui vivent dans des environnements hostiles tels que les sources chaudes, l'eau salée et les évents des grands fonds. Les eubactéries comprennent les bactéries qui sont plus familières aux humains. Les cyanobactéries, ou algues bleu-vert, appartiennent aux Eubactéries. D'autres eubactéries provoquent des maladies humaines telles que l'angine streptococcique et le botulisme.
