Les avantages des logiciels commerciaux incluent la fourniture de revenus, la disponibilité de fonctionnalités complètes, faciles à mettre en œuvre, moins chers et fiables, tandis que les inconvénients sont qu'ils nécessitent le paiement de frais annuels, peuvent ne pas répondre à des objectifs spécifiques et leurs exigences dépendent d'études de marché. Les logiciels commerciaux peuvent forcer différents groupes à se regrouper sur les exigences de données et de format, car ils suivent les entrées et les sorties des produits achetés.
Les logiciels commerciaux sont faciles à utiliser car ils sont dotés de toutes les fonctionnalités de programme nécessaires. L'utilisation de logiciels commerciaux est avantageuse en raison du manque de limites et de restrictions imposées aux utilisateurs. Le logiciel commercial est conçu de manière à permettre une mise en œuvre plus facile dans les systèmes existants sans recourir à la personnalisation. De plus, ils sont plus fiables et plus économiques que d'autres types de logiciels. La plupart des exigences relatives à l'utilisation de logiciels commerciaux sont déterminées par des études de marché, fournissant ainsi des services à jour. Les entreprises tirent profit de l'utilisation de logiciels commerciaux en raison de leur fiabilité, de leur disponibilité et de leur prix abordable.
Il est désavantageux d'utiliser des logiciels commerciaux car il faut payer avant de les utiliser. Dans d'autres cas, les clients doivent payer une redevance annuelle pour conserver et utiliser le logiciel. Un autre inconvénient des logiciels commerciaux est qu'ils ne parviennent pas à atteindre les objectifs spécifiques de chaque utilisateur, notamment en termes de programmes divers comme l'intégration avec la santé électronique. Trouver une solution à ce problème nécessite l'apport d'une entreprise de services professionnels, ce qui s'avère coûteux à long terme.