Les animaux qui vivent dans les marécages comprennent les alligators, les amphibiens, les coquillages, les ours et les panthères. Les animaux spécifiques présents varient selon que le marais est un marécage d'eau douce ou un marais d'eau salée.
De nombreuses espèces différentes de mammifères, d'oiseaux, de reptiles, d'amphibiens et de poissons vivent et prospèrent dans les écosystèmes marécageux. Les marécages d'eau salée sont riches en crustacés, crabes et conques. Ces zones marécageuses sont importantes car de nombreux poissons et amphibiens fraient ou pondent leurs œufs ici. Une fois les œufs éclos, les jeunes rampent dans l'eau.
Le parc national des Everglades, qui est une mangrove d'eau douce, abrite une multitude d'oiseaux, 24 espèces de reptiles, l'ours noir de Floride, le vison des Everglades et la panthère de Floride. Les mangroves, caractérisées par d'épais peuplements de palétuviers, offrent un abri, des sites de nidification et une protection à des dizaines d'espèces. Par exemple, les pygargues à tête blanche, les balbuzards pêcheurs, les faucons, les faucons pèlerins et les martins-pêcheurs se nourrissent dans les mangroves. Le héron tricolore, l'aigrette neigeuse et le petit héron bleu nichent dans les branches de la mangrove.
D'autres espèces ont élu domicile dans les eaux marécageuses autour des palétuviers. Le crocodile américain et l'alligator américain coexistent dans la mangrove des Everglades. La caouanne et la tortue verte passent une partie de leur vie dans la région. De nombreuses espèces en voie de disparition ou menacées sont originaires des marécages, notamment la couleuvre des marais et la panthère de Floride.
