Les infections respiratoires, en particulier la pneumonie, sont une cause majeure de décès chez les cobayes, ainsi que des diarrhées extrêmes, des infections bactériennes, des obstructions de la vessie et une surchauffe. Les cobayes succombent également à une intoxication accidentelle en mangeant de l'herbe ou des plantes traitées avec un insecticide.
Les cochons d'Inde sont très mignons, mais ce sont des créatures délicates qui doivent être surveillées de près pour déceler des signes de problèmes de santé graves. En dehors des causes naturelles, la pneumonie et les maladies respiratoires similaires sont à l'origine de nombreux décès chez ces animaux. Les cobayes sont des porteurs naturels de souches de bactéries respiratoires qui évoluent rapidement en pneumonie. Leurs vies peuvent être sauvées avec des antibiotiques et d'autres traitements médicaux d'urgence.
Selon le Veterinary Information Network, les cobayes ne transforment pas la vitamine C naturellement et doivent obtenir ce minéral vital par la nourriture qu'ils mangent. Le manque de vitamine C les amène à développer une maladie appelée scorbut, ce qui les rend plus vulnérables aux maladies. L'ajout d'un supplément de vitamine C à son alimentation résout ce problème.
Le VCA Animal Hospital déclare que l'urine sanglante indique des calculs vésicaux possibles, ce qui rend la miction difficile. La diarrhée chez le cobaye est très grave et entraîne une déshydratation rapide de l'animal. Les cobayes placés à des températures supérieures à 85 degrés avec une humidité élevée courent un grand risque de mourir d'un coup de chaleur. Un vétérinaire expérimenté dans le traitement des cobayes peut fournir une aide d'urgence pour ces maladies graves.