Alors que certains chrétiens ont utilisé les couleurs de l'arc-en-ciel pour interpréter ou usurper le sens des histoires bibliques, la Bible elle-même n'attribue aucune signification aux couleurs. L'arc-en-ciel n'apparaît que deux fois dans la Bible, dans le premier et le dernier livre. Les chrétiens pensent que sa première apparition dans l'histoire du déluge est spéciale, car l'histoire biblique du déluge est la seule qui comporte un arc-en-ciel. Dieu place un arc-en-ciel dans le ciel comme symbole que les pluies sont terminées et qu'un déluge de telles proportions ne reviendra jamais.
Les théories chrétiennes sur la signification supplémentaire de l'arc-en-ciel et de ses couleurs se concentrent principalement sur les tentatives de présenter une corrélation entre les sept couleurs de l'arc-en-ciel et les sept jours de la création. L'arc-en-ciel a également été utilisé pour établir des parallèles avec la lumière, en tant que première création de Dieu, et toutes les couleurs de la terre, en tant que reflets dans diverses combinaisons des couleurs représentées dans l'arc-en-ciel. Gradué plus loin, le point devient que Dieu a donné la lumière à l'homme pour nous montrer qu'il englobe toutes choses. Pour cette même raison, l'arc-en-ciel est parfois utilisé comme symbole de Jésus, à travers lequel les chrétiens croient que tout est possible.
Dans la Bible, la couleur rouge représente généralement le péché et le sang du Christ qui offre la rédemption. La Bible parle également du rouge comme couleur de la souffrance dans les livres d'Exode et d'Isaïe. En revanche, la couleur orange représente le jugement sur les actions humaines, comme le discutent les auteurs bibliques dans les livres des Psaumes et de l'Apocalypse. La poterie dans la Bible est souvent orange, et les personnages bibliques brisent parfois la poterie pour exprimer leur dégoût du comportement humain.
La couleur jaune représente la vie et la gloire éternelles. Dans de nombreux points de la Bible, une lueur jaune signifie la piété et le statut spirituel. De plus, dans le livre de Job, la couleur jaune représente l'amertume.
Le violet dans la Bible représente la royauté. Les rois de la Bible s'habillaient souvent de la couleur. De plus, les grands prêtres de la Bible ont utilisé la couleur violette pour la Porte du Tabernacle. Dans la Bible, le violet représente souvent la justice de Dieu et son plan pour amener la justice sur le monde.
Dans l'ensemble, Dieu affiche les couleurs de l'arc-en-ciel à la fin du déluge qui a détruit le monde. Les couleurs combinées représentent la puissance de Dieu, selon le livre d'Ézéchiel. Lorsque Dieu montre l'arc-en-ciel à Noé après le déluge, c'est Son signe que le plan de Dieu est de ne plus jamais détruire le monde par un déluge.
