Les cerisiers ont un système racinaire très superficiel. Alors que quelques arbres développent des systèmes racinaires très profonds, la plupart ont des racines qui ne poussent que de 12 à 16 pouces de profondeur - et les racines des cerisiers ne poussent généralement pas aussi profondément.
Les racines d'un cerisier ont deux fonctions principales. Les racines plus grosses ancrent l'arbre au sol et transportent les nutriments et l'eau vers le reste de l'arbre. Les racines nourricières plus petites tirent les nutriments et l'eau du sol, puis les envoient aux racines les plus grosses. Étant donné que ces racines plus grosses sont moins profondes et plus verticales que de nombreux autres arbres, elles peuvent endommager le béton et l'aménagement paysager. Il est préférable de planter des cerisiers là où il y a beaucoup d'espace en raison de leurs racines peu profondes.