Le Seigneur des Mouches, ou la bête, est une métaphore du chaos naturel qui existe dans la nature humaine. La transition de l'enfance à l'âge adulte comprend la conversion de ce chaos en un désir d'ordre , dans la plupart des cas, mais le manque de supervision d'un adulte à la suite de l'abandon des garçons signifie que le chaos n'est en grande partie pas maîtrisé.
Plusieurs autres métaphores sont à l'œuvre dans le roman classique de William Golding. La conque, par exemple, est une métaphore de la loi du monde adulte que les garçons ont laissée derrière eux. Piggy se donne pour mission de protéger la conque car la notion d'ordre l'apaise. Cependant, après que Roger ait démoli la conque, les garçons n'ont plus de signe d'autorité en place et l'anarchie règne sur l'île.
L'île elle-même est une métaphore de l'isolement que les garçons ont du reste de leur société. Sans aucun lien avec la société extérieure, les garçons doivent résoudre eux-mêmes leurs problèmes. La petite île devient un creuset idéal pour les faiblesses de la nature humaine.
Les lunettes sont une autre métaphore de la voix de la logique et de la raison parmi les survivants. Piggy garde une prise encore plus serrée sur les lunettes qu'il ne le fait sur la conque, les utilisant pour résoudre les problèmes des garçons, notamment l'allumage du feu, ce qui donne aux garçons leur meilleur espoir d'un sauvetage.