Certaines différences entre les algues et les champignons sont qu'elles appartiennent à des règnes taxonomiques différents et qu'elles obtiennent de l'énergie à partir de différentes sources. Les algues sont des organismes ressemblant à des plantes qui appartiennent au royaume Protista, tandis que les champignons appartiennent au royaume Fungi. Une autre différence réside dans les environnements dans lesquels ces organismes peuvent vivre.
Les algues sont des organismes photosynthétiques qui contiennent de la chlorophylle et peuvent fabriquer leur propre nourriture. Les algues vivent principalement dans les milieux aquatiques et ont besoin de la lumière du soleil pour survivre. Les algues peuvent inclure différents types d'organismes, tels que les algues vertes, les diatomées et les dinoflagellés.
D'autre part, les champignons sont des décomposeurs qui survivent soit en consommant de la matière morte, soit en mangeant d'autres organismes, qui sont leurs hôtes. Comme les champignons n'ont pas de chlorophylle, ces organismes ne peuvent pas produire de nourriture comme le font les algues. Ce sont des hétérotrophes, tandis que les algues sont des autotrophes. Les champignons vivent dans le sol, l'air et l'eau et peuvent prospérer à la fois au soleil et dans l'obscurité. Certains types de champignons sont les champignons, les moisissures et les levures.