Selon Nature.com, l'aigle royal est au sommet de la chaîne alimentaire, au-dessus des plantes, des écureuils et des scorpions. Les plantes sont considérées comme des producteurs primaires et constituent le premier niveau de la chaîne alimentaire . Les spermophiles, qui sont les principaux consommateurs, se situent au deuxième niveau et se nourrissent de végétaux. Les aigles royaux sont des consommateurs tertiaires, ce qui signifie qu'ils s'attaquent aux consommateurs primaires et secondaires.
Les aigles royaux s'attaquent aux petits mammifères qui constituent le principal groupe de consommateurs, tels que les lapins, les chiens de prairie et les marmottes. Ils se nourrissent également de cerfs, de chèvres de montagne, de mouflons d'Amérique et d'antilopes, qui se nourrissent tous d'herbe et de plantes. Bien que ces animaux soient des consommateurs primaires, ils sont beaucoup plus gros que les petits mammifères et les aigles royaux. Les aigles royaux mangent une grande variété d'animaux, tels que des reptiles, des poissons, des oiseaux et des insectes. Ils représentent également une menace pour les animaux d'élevage. Ces oiseaux tuent et mangent parfois des phoques et des blaireaux. Dans de rares cas, les aigles royaux ont tué et mangé d'autres prédateurs comme les coyotes et les lynx roux. Dans un modèle de chaîne alimentaire qui inclut les coyotes comme proies de l'aigle royal, la chaîne commence par des plantes ou « autotrophes ». Le principal groupe de consommateurs comprend les sauterelles, les souris et les écureuils. Les coyotes prennent leur place au troisième niveau, en tant que consommateurs secondaires, et l'aigle royal règne en tant que consommateur tertiaire.
