Comme les autres races de chiens miniatures, les chiens maltais sont sujets à l'hypoglycémie ou à l'hypotension artérielle. Ils doivent donc être nourris de petites quantités d'aliments pour chiens de haute qualité, pauvres en additifs et en charges tout au long de la journée. Idéalement, 40 à 50 pour cent des calories quotidiennes d'un Maltais devraient provenir de la viande.
Les chiens maltais ne doivent jamais être des restes de table d'alimentation ou des os. Les restes de table peuvent perturber leur système digestif sensible, tandis que les os cuits peuvent se briser et blesser leurs intestins ou leur estomac. Parce que les chiens maltais ont un appétit délicat, certains propriétaires préfèrent cuisiner des repas à la maison, en visant un équilibre entre viande, légumes et amidon. De préférence, 25 à 35 pour cent des calories quotidiennes d'un Maltais devraient provenir de légumes cuits à la vapeur ou crus. Les 25 à 35 pour cent restants peuvent être constitués de riz blanc ou brun, ou de pâtes.
Lors de l'achat d'aliments pour chiens, les marques qui annoncent des quantités modérées de graisses animales et de grandes quantités de protéines sont suggérées. Les aliments humides doivent avoir une teneur élevée en humidité. La plupart des aliments secs contiennent des céréales comme charges, ce qui n'est pas recommandé, car les carnivores comme les chiens n'ont pas besoin de céréales. Les marques qui n'utilisent pas de sous-produits animaux sont idéales. Les chiens ne doivent pas être nourris avec du soja; il a été démontré qu'il affecte négativement leur système endocrinien.
