La fragmentation de l'habitat se produit lorsqu'un habitat est altéré ou disjoint. En conséquence, il existe une séparation spatiale dans un habitat qui redistribue les espèces et les organismes au sein de l'habitat.
La fragmentation de l'habitat peut se produire naturellement ou à cause de l'homme. Naturellement, les glaciers, l'activité volcanique, les mouvements tectoniques des plaques, l'élévation du niveau de la mer et le changement climatique peuvent tous provoquer la fragmentation et la dissociation des habitats. Ces occurrences peuvent entraîner une modification radicale de petits habitats tels que les habitats de micro-organismes ou peuvent affecter un habitat plus vaste tel qu'une grande masse continentale. Les humains provoquent également la fragmentation de l'habitat en construisant de nouveaux bâtiments, en modifiant les paysages et en abattant ou en plantant des arbres.
