Les cils et les flagelles sont tous deux des structures ressemblant à des cheveux utilisées pour le mouvement des cellules eucaryotes. Les cils et les flagelles peuvent être trouvés dans les cellules végétales ainsi que dans les spermatozoïdes de mammifères.
Les cils et les flagelles sont des organites qui tapissent la surface des cellules eucaryotes. Ces protubérances ressemblant à des cheveux se déplacent par vagues, facilitant le mouvement de la cellule. Leur structure est similaire, mais les cils sont plus courts et souvent plus nombreux que les flagelles. Les deux sont formés de microtubules qui glissent les uns contre les autres, créant le mouvement qui génère le mouvement cellulaire. En plus de déplacer les cellules, les cils aident également au mouvement des liquides, le plus souvent dans le système reproducteur féminin.