Dans la génétique humaine, les yeux noisette sont une caractéristique récessive. Les couleurs des yeux plus claires sont récessives aux couleurs des yeux plus foncées ; cela signifie que les yeux marrons sont dominants sur toutes les autres couleurs d'yeux.
Tous les humains héritent de leurs parents deux allèles, ou formes de gènes, qui régissent la couleur des yeux. Le gène HERC2 possède deux allèles, brun et bleu. Les autres gènes de la couleur des yeux, les gènes gey et bey2, travaillent ensemble pour dicter les différentes nuances. La couleur des yeux de chaque personne dépend des deux allèles dont elle hérite.
L'allèle brun HERC2 est dominant dans l'ensemble, donc toute personne qui hérite d'un allèle brun HERC2 aura les yeux bruns, quel que soit l'autre allèle. La combinaison de bey2 et de gey fait des yeux marrons, verts, noisette ou bleus. Ces différents allèles dictent la quantité de mélanine à fabriquer, et plus de mélanine signifie une couleur des yeux plus foncée.