Alors que les nageoires d'une baleine ont une structure et une fonction similaires à celles d'un poisson, les baleines et les poissons ne sont pas étroitement liés, de sorte que leurs similitudes sont définies comme analogues et non homologues. Le développement des nageoires dans deux de ces animaux non apparentés sont un exemple d'évolution convergente.
En revanche, les structures homologues sont généralement le résultat d'une évolution divergente, lorsque deux espèces se développent à partir d'un ancêtre commun. La queue d'un singe et l'os de la queue humaine, ou coccyx, sont des exemples de structures homologues. Les humains et les singes se sont développés à partir d'un ancêtre commun qui avait une queue, mais alors que les singes ont conservé la structure au fur et à mesure de leur évolution, les humains ne l'ont pas fait.
