Selon la Humane Society des États-Unis, les cobayes apprécient la pastèque, mais il est préférable de l'utiliser comme friandise. La pastèque, comme de nombreux fruits, contient beaucoup de sucre et d'eau.
Les cochons d'Inde ont un système digestif plutôt sensible, et une trop grande quantité de certains aliments entraîne des selles molles ou de la diarrhée. La meilleure nourriture pour un cobaye est constituée de granulés commerciaux de haute qualité à base de foin de fléole. Les pastilles doivent être enrichies de vitamine C et ne doivent pas contenir de colorants artificiels, d'édulcorants ou de charges.
Le foin de fléole des prés frais est également un aliment de base important pour les cobayes. Le foin fournit des fibres, aide à contrôler la croissance des dents des cobayes et sert de litière. La plupart des légumes-feuilles lavés sont de bons aliments pour les cobayes, et d'autres légumes offrent une certaine variété.
