Les chihuahuas, tout comme la plupart des autres races de chiens, perdent des poils toute l'année et peuvent en perdre davantage au printemps ou à l'automne. En raison de sa petite taille, la perte de poils peut ne pas être aussi apparente que celle de grandes races de chiens.
Les chihuahuas ont des types de pelage à une ou deux couches. Un chihuahua à une seule couche peut perdre moins. Il pousse des poils longs et gonflés qui, contrairement aux autres races à poils longs, nécessitent un minimum de tonte et de toilettage. Ceux dont le sous-poil est lisse et court perdent beaucoup au printemps et à l'automne. Leurs poils lisses qui reposent directement sur leur peau leur donnent l'impression qu'ils n'ont pas de fourrure du tout, surtout si le Chihuahua a un pelage brun.